該洞自古即傳說紛紜，相傳明永曆十五年，明遺臣延平郡王鄭成功，光復台澎，驅走荷人，少數黑奴被棄於此，潛居該洞，洞在岩石隙縫間，俯瞰黯然深黑，不知深長幾許，據傳清時洞中之石桌、石椅、石床、石碗等器皿，尚俱全，銀器、珠寶等亦時有發現，可惜於今洞口塌陷已不能進入。

風景區斷續相連約二十餘洞，天造人塑、各有特色，重要景點包括：(一)曲徑探幽；(二)天外天；(三)蝙蝠洞；(四)情人坪；(五)仙人洞；(六)仙人泉；(七)怡然園；(八)迷人陣；(九)一線天；(十)榕岩谷；(十一)寧靜谷；(十二)望海亭；(十三)美人洞等。

小琉球白燈塔整座塔之造為混凝土圓形白色，高度自基座至塔頂一十公尺，水平面至塔頂有八十八公尺之高，為第四等閃光（每二秒二一，閃光一次），其光度射程可達二十浬之遠，亮如白晝，日夜自行閃光，屬國際性燈塔。

白沙觀光港為遊客進出之主要港口，緊鄰海岸線優美的中澳沙灘，深具遊憩價值，港區內之遊客服務中心，除了提供交通船的搭乘外，尚有海上環島船以及海底半淺艇，提供給遊客多樣化的環島新選擇。除了滿天星空，對岸高雄加工區的閃爍燈火盡收眼底，是觀看小琉球夜景的最佳景點。

花瓶石為小琉球島上最著名的景點，其形成原因是原本的海岸珊瑚礁被地殼隆起作用所抬升，然後頸部受到長期的海水侵蝕作用，因此形成上粗下細，類似花瓶的特殊造型，加上岩頂上長滿了臭娘子以及盒果籐等植物，如同插著花草的花瓶，因此便取名為「花瓶石」。

小琉球非常適合箱網養殖，在島嶼周圍環繞兩股太平洋黑潮流、加上潔淨海水的天然條件下，近年來成為外銷日本的主要重點。裡頭飼養魚類有紅甘、海鱺、石斑等，由於飼養方法不同於傳統方式，也成為到小琉球一定要去觀光的重要據點之一。

昔日的圖書館，如今重新出發變身成為小琉球遊客中心，可別小看這一座離島管理站，對於島上居民而言以及前來旅遊的遊客們，都會是一個很有用的新地標唷！

小琉球沿海主要是侵蝕性的珊瑚礁岩岸，只有幾個屬於堆積地形的沙岸，其中規模最大的就是位於西部蛤板至烏鬼洞一帶的威尼斯沙灘。威尼斯沙灘屬於貝殼沙沙灘，約有一百公尺長，人們可以在此親近大海，進行浮潛、游泳、玩水等遊憩活動。此外，在傍晚的時候遊客可以在此欣賞海面上的日落美景。

三隆宮（王爺廟）供奉朱府、池府、吳府三姓王爺，俗稱三府千歲。《琉球庄管內狀況一覽》記載，光緒十七年（1891）一月十八日庄民一同出金建設「三山國王廟」。大正十四年（1925）一月整建，大正十五年（1926）四月竣工。昭和三年（1928）五月三日再度改築，並改稱「三隆宮」。

位於小琉球北方山崖上，當乘坐交通船可以看見由三座殿宇相連而成的靈山寺，寺廟由陳乃等仕紳募資興建，並有台灣省警備總部琉球職訓三總隊、海軍實踐隊大力幫助，從民國四十六年開始耗費三年完成。寺內供奉釋迦牟尼佛祖、臨水夫人陳靖姑以及前殿的五府千歲大殿。

海子口位於琉球嶼最南端，為琉球島上六個港口之一，港口兩側為消波塊，適合從事海釣、欣賞海景活動。

竹林生態濕地公園位於琉球嶼島中央碧雲寺下方，引用當地終年水流不斷的龍目井泉水構築生態池塘，並使用當地盛產之咾咕石，於竹林下鋪設石板步道與木棧。園中融合竹林與涼亭美景，在夜間燈光照射下，聽著潺潺流水聲，仰望滿天星空，格外寧靜悠閒。

在琉球嶼東北方的龍蝦洞一帶珊瑚礁海岸，分布著許多壺穴小地形與海蝕溝。其壺穴屬於海成壺穴，壺口呈現圓形，底部因為溶蝕作用與再沉澱作用而變得很平坦。龍蝦洞的海蝕溝外觀寬且深，非常發達。每當海浪進入溝中，潮聲如吼，頗為壯觀。

望海亭位於美人洞景點的靠海側，居高臨下可以欣賞到琉球嶼的海崖、珊瑚裙礁海岸與海水箱網養殖。在望海亭西側海岸有一個海階，原本是在海岸邊的海蝕平台，因為陸地持續受到抬升作用而隆起，形成頂面平坦而邊坡陡直的海階地形，配合測量海階高度與珊瑚礁的碳十四定年可以估算琉球嶼地殼隆起的速率。

沿岸是綿延不絕的珊瑚裙礁，在裙礁內則是大片平坦的海蝕平台，受到海水的侵蝕作用，全區海蝕平台呈現凹凸不平的狀態，怪石嶙峋，與其他景點的景觀截然不同。因尚未經過人為開發，整體自然景觀還保持得很完整，加上鄰近海岸公路，因此吸引許多觀光客到此駐足欣賞美麗的自然風光。

大福漁港為小琉球的第二漁港，民國68年闢建，當時為暫緩白沙港的船隻量，提供漁船休息避風用地，故增建本港作為白沙尾港的輔助港。本港主要為遠洋漁船及公營交通船停舶地點，漁村風味濃厚。

景點與烏鬼洞銜接相通。此溝傳因山豬出沒而得名，又傳以前有一隻山豬精可隨意化成人形。有一天，山豬精發現海邊沐浴的仙女，暗地將仙女的衣衫竊走，仙女沒衣裳無法升天，山豬精脅迫求婚，仙女佯為應允，騙山豬精交還衣服穿好衣裳昇天而去，山豬精最後為情而憤死，於是後人就把這個山溝稱為山豬溝。

位於小琉球島嶼西側，附近有許多特殊的海蝕景點。與其他景點相比，景點所具有的地形、地質景觀具備完整性，尤其是小型的海蝕壺穴，在其他地區並沒有發現，因此具有某種程度的特殊性，也值得遊客到此細細地欣賞。

在琉球嶼東側由龍蝦洞至白沙新港間的沙灘為「中澳沙灘」，也是琉球嶼上的主要沙灘之一。其主要是由珊瑚礁碎屑、有孔蟲與貝殼碎屑所組成的海積地形。除了適合海濱遊憩活動之外，中澳沙灘也可以進行潮間帶生物觀察與夜間的觀景活動。

位於厚石一帶，其石正面貌似老鼠、背面貌似山豬，故又名山豬石。

位於琉球嶼西側，面臨壯麗的台灣海峽。落日時分，火紅的太陽緩緩地落入海水面之下。在落日亭附近的海岸屬於珊瑚礁海岸，可以欣賞到隆起珊瑚礁與美麗的海岸。

位於衫福漁港北側，有許多特殊的海蝕地形，如海蝕柱、海蝕凹壁和海蝕壺穴。海蝕柱的外形類似香菇，上寬下窄，是由於海水長期侵蝕下方凹陷部分形成。海蝕穴則是指在海蝕平台上外形呈現不規則圓形，中間凹陷的洞穴。海蝕壺穴則是由於海水的流動與拍打，加上鹽份的重複乾濕侵蝕而形成。

位於生態廊道北邊，不同於本島的沙灘海岸，肚仔坪與衫福漁港是島上兩個重要潮間帶觀賞處之一，擁有豐富的潮間帶生態。

觀音石位於厚石一帶，因外貌酷似面海觀音沉思佇立的模樣而得名。 與花瓶石、紅番石併列為小琉球三大地標。

位於厚石裙礁一帶，鄰近觀音石、老鼠石、爬山虎，紅番石為一顆珊瑚礁岩，遠望有如印地安人頭。在早晨日出時，與鄰近岩石背光景象，宛如戀人相望，十分浪漫。

海子口位於小琉球嶼最南端，為小琉球島上六個港口之一，港口兩側為消波塊，適合從事海釣、欣賞海景活動。

位於大寮莊山頂，恰當琉球嶼之中心，主奉觀世音菩薩，當地居民無論婚喪喜慶、求漁船滿載等等，必前來求籤請示，是鄉民最重要的精神信仰。據說鄉民求卜都很靈驗，因此香火鼎盛。